45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3419 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  100 
 
 		 394 aa  819    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  57.34 
 
 		 510 aa  428  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  43.72 
 
 		 489 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  45.09 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  47.04 
 
 		 459 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  35.54 
 
 		 509 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  31.14 
 
 		 506 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  29.17 
 
 		 579 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  30.63 
 
 		 580 aa  162  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  29.58 
 
 		 542 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  33.11 
 
 		 565 aa  159  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  31.61 
 
 		 571 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  30.56 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  28.61 
 
 		 471 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  27.62 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  32.51 
 
 		 463 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  32.51 
 
 		 463 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  32.56 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  29.63 
 
 		 444 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  31.09 
 
 		 443 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  26.5 
 
 		 564 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_002978  WD1179  hypothetical protein  23.55 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  25.95 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  25.7 
 
 		 622 aa  72.8  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  25.5 
 
 		 591 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  24.15 
 
 		 594 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  24.54 
 
 		 623 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  25.28 
 
 		 615 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  25.09 
 
 		 628 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  25.09 
 
 		 628 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  25.09 
 
 		 628 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  37.97 
 
 		 1093 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  24.21 
 
 		 644 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  24.51 
 
 		 647 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  23.39 
 
 		 601 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  25.18 
 
 		 758 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  19.8 
 
 		 513 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  24.71 
 
 		 650 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  21.92 
 
 		 715 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  23.67 
 
 		 784 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  28.57 
 
 		 671 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  24.58 
 
 		 672 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  20.5 
 
 		 749 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  28.04 
 
 		 1065 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1968  KAP P-loop domain protein  24 
 
 		 1137 aa  42.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>