54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2211 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  100 
 
 		 650 aa  1308    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  72.46 
 
 		 644 aa  957    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  72.63 
 
 		 647 aa  957    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  32.27 
 
 		 615 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  34.17 
 
 		 623 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  33.75 
 
 		 622 aa  263  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  30.9 
 
 		 628 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  30.9 
 
 		 628 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  30.9 
 
 		 628 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  30.91 
 
 		 594 aa  232  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  31.6 
 
 		 671 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  30.52 
 
 		 591 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  29.2 
 
 		 601 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  25.44 
 
 		 728 aa  87.8  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  26.49 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  24.83 
 
 		 564 aa  79.7  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  26.05 
 
 		 749 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  26.55 
 
 		 467 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  25.53 
 
 		 787 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1968  KAP P-loop domain protein  23.02 
 
 		 1137 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  22.39 
 
 		 1093 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  24.11 
 
 		 770 aa  72.8  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  26.79 
 
 		 736 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1065 aa  67.4  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  22.22 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  27.16 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  22.44 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  22.44 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  25.4 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  36 
 
 		 489 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.28 
 
 		 830 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  22.8 
 
 		 862 aa  55.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  23.86 
 
 		 715 aa  54.7  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  21.18 
 
 		 565 aa  54.7  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  24.42 
 
 		 758 aa  54.7  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  28.46 
 
 		 611 aa  54.3  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  23.91 
 
 		 315 aa  52.8  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  26.79 
 
 		 444 aa  51.2  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  30.67 
 
 		 459 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  24.71 
 
 		 394 aa  51.2  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  30.49 
 
 		 488 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  25.96 
 
 		 579 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  25 
 
 		 580 aa  50.4  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  21.89 
 
 		 509 aa  50.4  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0709  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1064 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2201  KAP P-loop  28.45 
 
 		 1128 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  36.96 
 
 		 884 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  24.18 
 
 		 571 aa  47.4  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  23.51 
 
 		 506 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  25.89 
 
 		 706 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3848  KAP P-loop domain-containing protein  29 
 
 		 925 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000964208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  24.43 
 
 		 542 aa  46.6  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  44.68 
 
 		 510 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  24.81 
 
 		 784 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>