20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0709 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0709  hypothetical protein  100 
 
 		 1064 aa  2121    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1065 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  25.1 
 
 		 770 aa  53.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  39.44 
 
 		 787 aa  53.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  36 
 
 		 671 aa  52  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  30.77 
 
 		 315 aa  50.8  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3848  KAP P-loop domain-containing protein  21.67 
 
 		 925 aa  50.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000964208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.36 
 
 		 830 aa  50.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  25.19 
 
 		 650 aa  49.7  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  43.14 
 
 		 749 aa  48.9  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  24.48 
 
 		 647 aa  48.5  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  33.96 
 
 		 509 aa  47.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  36.07 
 
 		 461 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  23.78 
 
 		 644 aa  46.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  40.38 
 
 		 467 aa  45.8  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  38.46 
 
 		 542 aa  45.8  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  38.46 
 
 		 594 aa  45.8  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  32.88 
 
 		 601 aa  45.1  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  31.34 
 
 		 1093 aa  45.1  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1116  hypothetical protein  23.44 
 
 		 692 aa  44.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.209405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>