42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1014 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  100 
 
 		 315 aa  627  1e-178  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  35.43 
 
 		 706 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  29.02 
 
 		 758 aa  159  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  37.5 
 
 		 749 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  35.74 
 
 		 728 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  39.11 
 
 		 884 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  29.3 
 
 		 715 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  34.51 
 
 		 736 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  28.61 
 
 		 862 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  25.86 
 
 		 735 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  26.36 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  25.87 
 
 		 706 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  31.03 
 
 		 945 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  30.08 
 
 		 784 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  26.07 
 
 		 672 aa  89.4  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  28.31 
 
 		 564 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  42.86 
 
 		 577 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2072  KAP P-loop  23.08 
 
 		 997 aa  68.9  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.285295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1936  hypothetical protein  22.89 
 
 		 978 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000106944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  25.21 
 
 		 461 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  24.07 
 
 		 650 aa  56.6  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  21.99 
 
 		 976 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  24.62 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  22.64 
 
 		 647 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  23.37 
 
 		 622 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  22.14 
 
 		 591 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  24.41 
 
 		 644 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  21.38 
 
 		 671 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  19.61 
 
 		 615 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  20.7 
 
 		 1093 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0709  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1064 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  20.23 
 
 		 623 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  21.69 
 
 		 830 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  21.82 
 
 		 510 aa  46.2  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  18.51 
 
 		 628 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  18.51 
 
 		 628 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  18.51 
 
 		 628 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  18.31 
 
 		 594 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1065 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  21.4 
 
 		 394 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  22.73 
 
 		 787 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2201  KAP P-loop  30.43 
 
 		 1128 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>