61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4250 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 		 594 aa  1210    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  44.95 
 
 		 591 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  43.05 
 
 		 601 aa  459  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  38.06 
 
 		 623 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  36.85 
 
 		 615 aa  364  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  34.28 
 
 		 622 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  35.25 
 
 		 628 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  35.25 
 
 		 628 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  35.25 
 
 		 628 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  33.85 
 
 		 644 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  30.91 
 
 		 650 aa  232  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  30.65 
 
 		 647 aa  230  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  24.51 
 
 		 671 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  24.59 
 
 		 564 aa  92.8  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  24.05 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  24.07 
 
 		 736 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  25.09 
 
 		 758 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  19.8 
 
 		 728 aa  68.2  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  24.26 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  24.15 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  24.73 
 
 		 749 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  23.94 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  29.85 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  23.93 
 
 		 489 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  24.1 
 
 		 463 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  24.1 
 
 		 463 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  23.02 
 
 		 715 aa  62.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  23.59 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1968  KAP P-loop domain protein  22.74 
 
 		 1137 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  22.66 
 
 		 884 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3848  KAP P-loop domain-containing protein  34.02 
 
 		 925 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000964208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  24.7 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  22.76 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  24.67 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  23.17 
 
 		 706 aa  57.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  24.38 
 
 		 787 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.47 
 
 		 830 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  24.19 
 
 		 445 aa  55.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  32.53 
 
 		 459 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  23.68 
 
 		 513 aa  55.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1065 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  27.54 
 
 		 770 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  25.56 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  35.53 
 
 		 443 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  25.32 
 
 		 579 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  23.76 
 
 		 735 aa  51.2  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  25.81 
 
 		 577 aa  50.8  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  21.77 
 
 		 784 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  25 
 
 		 1093 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  29.47 
 
 		 706 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  23.63 
 
 		 565 aa  48.9  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  28.57 
 
 		 419 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2201  KAP P-loop  31.91 
 
 		 1128 aa  47.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  23.18 
 
 		 611 aa  47.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  22.71 
 
 		 571 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  20.21 
 
 		 315 aa  45.4  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  23.95 
 
 		 542 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0709  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1064 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  35.42 
 
 		 580 aa  43.5  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  19.77 
 
 		 945 aa  43.5  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  17.29 
 
 		 862 aa  43.5  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>