21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2072 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2072  KAP P-loop  100 
 
 		 997 aa  2042    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.285295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1936  hypothetical protein  59.08 
 
 		 978 aa  1151    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000106944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  29.01 
 
 		 976 aa  412  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  30.16 
 
 		 749 aa  101  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  26.14 
 
 		 728 aa  92  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  24.23 
 
 		 706 aa  89.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  21.56 
 
 		 736 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  21.72 
 
 		 715 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  22.67 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  27.22 
 
 		 884 aa  68.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  23.88 
 
 		 672 aa  65.5  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  27.97 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  21.33 
 
 		 945 aa  63.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  26.98 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  22.43 
 
 		 735 aa  56.6  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  25.45 
 
 		 463 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  25.45 
 
 		 463 aa  53.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  22.61 
 
 		 644 aa  52  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  22.45 
 
 		 647 aa  51.6  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  29.59 
 
 		 758 aa  47  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2597  KAP P-loop domain protein  22.92 
 
 		 760 aa  45.1  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.207911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>