47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1598 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  100 
 
 		 749 aa  1528    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  35.2 
 
 		 728 aa  388  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  37.7 
 
 		 577 aa  350  5e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  37.12 
 
 		 884 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  30.43 
 
 		 736 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  28.21 
 
 		 706 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  26 
 
 		 758 aa  157  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  37.11 
 
 		 315 aa  139  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  24.9 
 
 		 706 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  24.12 
 
 		 862 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  26.39 
 
 		 715 aa  127  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  26.58 
 
 		 784 aa  124  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  28.7 
 
 		 419 aa  103  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2072  KAP P-loop  30.16 
 
 		 997 aa  102  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.285295 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  31.58 
 
 		 564 aa  95.1  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  26.5 
 
 		 735 aa  95.1  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  23.62 
 
 		 672 aa  81.3  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  26.05 
 
 		 650 aa  79.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1936  hypothetical protein  25.83 
 
 		 978 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000106944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  26.33 
 
 		 647 aa  78.2  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  23.27 
 
 		 601 aa  77.8  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  25.74 
 
 		 644 aa  77  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  23.64 
 
 		 945 aa  74.3  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  25.73 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  24.29 
 
 		 623 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  24.73 
 
 		 594 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  24.55 
 
 		 671 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  23.46 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  20.68 
 
 		 615 aa  62.4  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  22.18 
 
 		 976 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  21.73 
 
 		 1093 aa  58.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  24.54 
 
 		 622 aa  58.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  23.74 
 
 		 467 aa  54.3  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  22.84 
 
 		 513 aa  54.3  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  32.04 
 
 		 787 aa  54.3  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  27.87 
 
 		 628 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  27.87 
 
 		 628 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  27.87 
 
 		 628 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  23.28 
 
 		 463 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  23.28 
 
 		 463 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.64 
 
 		 830 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0709  hypothetical protein  43.14 
 
 		 1064 aa  49.3  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1065 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1968  KAP P-loop domain protein  22.35 
 
 		 1137 aa  48.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2201  KAP P-loop  30.43 
 
 		 1128 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  23.34 
 
 		 464 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  20.5 
 
 		 394 aa  45.8  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>