40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2745 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  100 
 
 		 1065 aa  2076    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  36.24 
 
 		 787 aa  238  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  27.53 
 
 		 671 aa  92.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  24.04 
 
 		 513 aa  86.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3848  KAP P-loop domain-containing protein  22.57 
 
 		 925 aa  81.6  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000964208 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  22.4 
 
 		 564 aa  80.9  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  26.42 
 
 		 622 aa  73.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  23.21 
 
 		 650 aa  70.1  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  20.56 
 
 		 830 aa  68.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  29.17 
 
 		 611 aa  68.2  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  26.44 
 
 		 623 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  24.93 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  23.86 
 
 		 647 aa  63.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0606  hypothetical protein  25.79 
 
 		 219 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  38.3 
 
 		 628 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  38.3 
 
 		 628 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  38.3 
 
 		 628 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  25.76 
 
 		 736 aa  58.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  34.82 
 
 		 770 aa  58.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  27.7 
 
 		 601 aa  57.4  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  35.48 
 
 		 644 aa  56.6  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0709  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1064 aa  55.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  34.88 
 
 		 594 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  34.65 
 
 		 758 aa  53.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  38.1 
 
 		 615 aa  53.5  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  42 
 
 		 1093 aa  52  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  32.95 
 
 		 459 aa  51.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  30.07 
 
 		 471 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  29.13 
 
 		 488 aa  50.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  30.21 
 
 		 489 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  31.46 
 
 		 591 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  30.33 
 
 		 749 aa  48.5  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  38.81 
 
 		 510 aa  47.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  24.04 
 
 		 862 aa  47.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  23.13 
 
 		 728 aa  48.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  25.74 
 
 		 706 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  32.05 
 
 		 542 aa  45.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  26.21 
 
 		 715 aa  45.1  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  28.04 
 
 		 394 aa  44.7  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  25.25 
 
 		 315 aa  44.7  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>