27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2201 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2201  KAP P-loop  100 
 
 		 1128 aa  2313    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  20.87 
 
 		 1093 aa  90.1  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1968  KAP P-loop domain protein  26.1 
 
 		 1137 aa  88.6  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  23.68 
 
 		 671 aa  67.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  24.32 
 
 		 513 aa  67.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  19.07 
 
 		 830 aa  66.6  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  23.96 
 
 		 628 aa  67  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  23.96 
 
 		 628 aa  67  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  23.96 
 
 		 628 aa  67  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  26.83 
 
 		 615 aa  65.5  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  23.85 
 
 		 650 aa  64.3  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  23.32 
 
 		 647 aa  63.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  25.44 
 
 		 591 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  22.87 
 
 		 644 aa  63.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  24.68 
 
 		 622 aa  58.9  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  34.09 
 
 		 728 aa  58.5  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  22.17 
 
 		 758 aa  57  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3848  KAP P-loop domain-containing protein  22.97 
 
 		 925 aa  53.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000964208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  22.24 
 
 		 623 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  22.32 
 
 		 594 aa  52.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  24.28 
 
 		 601 aa  51.6  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  28.57 
 
 		 884 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  34.62 
 
 		 787 aa  49.7  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  27.42 
 
 		 461 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  30.43 
 
 		 749 aa  47  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  21.47 
 
 		 715 aa  46.6  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  19.41 
 
 		 862 aa  45.4  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>