40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3618 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 830 aa  1706    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3848  KAP P-loop domain-containing protein  28.11 
 
 		 925 aa  204  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000964208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  23.61 
 
 		 647 aa  79  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  22.62 
 
 		 591 aa  74.3  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  32.63 
 
 		 671 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  21.85 
 
 		 787 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  19.95 
 
 		 1065 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  35.23 
 
 		 736 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  29.41 
 
 		 623 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  32.35 
 
 		 461 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2201  KAP P-loop  19.51 
 
 		 1128 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  25.33 
 
 		 644 aa  58.9  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  25.76 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  25.76 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  25.76 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  25.45 
 
 		 615 aa  57  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  23.28 
 
 		 650 aa  56.6  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  27.27 
 
 		 601 aa  55.8  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  26.47 
 
 		 594 aa  55.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  29.7 
 
 		 622 aa  53.9  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  30.56 
 
 		 564 aa  52.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  27.78 
 
 		 728 aa  52  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0709  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1064 aa  50.8  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  33.68 
 
 		 542 aa  50.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  25.64 
 
 		 749 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  25 
 
 		 770 aa  48.5  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  28.05 
 
 		 1093 aa  48.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  25.24 
 
 		 513 aa  47.8  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  31.82 
 
 		 706 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  33.33 
 
 		 884 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  32.94 
 
 		 443 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  26.42 
 
 		 509 aa  46.2  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  25.3 
 
 		 471 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  29.59 
 
 		 571 aa  45.8  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  21.69 
 
 		 315 aa  45.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  40.82 
 
 		 565 aa  45.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  29.55 
 
 		 577 aa  45.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  25 
 
 		 758 aa  45.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  20.08 
 
 		 611 aa  44.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  32.53 
 
 		 862 aa  44.7  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>