34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1639 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 
862 aa  1739    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  27.29 
 
 
728 aa  154  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  26.41 
 
 
706 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  29.81 
 
 
884 aa  145  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  30.27 
 
 
736 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  24.12 
 
 
749 aa  130  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  24.5 
 
 
758 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  28.79 
 
 
315 aa  115  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  27.27 
 
 
577 aa  110  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  24.54 
 
 
715 aa  109  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  25.25 
 
 
784 aa  99  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  21.04 
 
 
706 aa  95.5  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  22.05 
 
 
735 aa  83.2  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  24.56 
 
 
419 aa  77  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  22.04 
 
 
564 aa  71.2  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  20.09 
 
 
671 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  25.66 
 
 
945 aa  60.8  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  19.37 
 
 
601 aa  58.9  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  21.29 
 
 
644 aa  58.2  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  22.8 
 
 
650 aa  55.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  20.65 
 
 
647 aa  55.1  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  21.27 
 
 
672 aa  53.5  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  19.61 
 
 
623 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  18.89 
 
 
615 aa  52.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  32 
 
 
611 aa  50.8  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  21.15 
 
 
787 aa  50.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  19.27 
 
 
622 aa  50.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  18.62 
 
 
628 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  18.62 
 
 
628 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  18.62 
 
 
628 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  24.04 
 
 
1065 aa  47.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3848  KAP P-loop domain-containing protein  31.76 
 
 
925 aa  47.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000964208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  20.98 
 
 
1114 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.53 
 
 
830 aa  44.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>