42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0010 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 		 728 aa  1486    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  41.73 
 
 		 577 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  35.2 
 
 		 749 aa  388  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  31.26 
 
 		 884 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  27.85 
 
 		 706 aa  207  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  30.07 
 
 		 736 aa  170  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  27.29 
 
 		 862 aa  154  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  26.52 
 
 		 758 aa  141  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  24.94 
 
 		 706 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  36.14 
 
 		 315 aa  135  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  26.11 
 
 		 715 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  23.75 
 
 		 784 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  24.07 
 
 		 419 aa  99  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  24.93 
 
 		 735 aa  97.8  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2072  KAP P-loop  26.14 
 
 		 997 aa  92  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.285295 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  25.88 
 
 		 672 aa  89  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  25.44 
 
 		 650 aa  87.8  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  23.99 
 
 		 644 aa  84.3  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  23.6 
 
 		 647 aa  80.5  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  27.47 
 
 		 945 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1936  hypothetical protein  23.4 
 
 		 978 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000106944 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  26.43 
 
 		 564 aa  75.1  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  26.34 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  19.8 
 
 		 594 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  19.43 
 
 		 601 aa  64.3  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  21.88 
 
 		 615 aa  63.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  21.13 
 
 		 591 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  22.22 
 
 		 622 aa  62  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  22.85 
 
 		 623 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2201  KAP P-loop  34.09 
 
 		 1128 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  19.05 
 
 		 671 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  19.93 
 
 		 628 aa  54.7  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  19.91 
 
 		 513 aa  54.7  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  19.93 
 
 		 628 aa  54.7  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  19.93 
 
 		 628 aa  54.7  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.78 
 
 		 830 aa  52  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  21.43 
 
 		 976 aa  52  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1065 aa  48.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  24.01 
 
 		 467 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1968  KAP P-loop domain protein  29.7 
 
 		 1137 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  22.82 
 
 		 770 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  26.09 
 
 		 787 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>