41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0090 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  100 
 
 		 706 aa  1436    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  26.29 
 
 		 758 aa  251  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  27.85 
 
 		 728 aa  207  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  28.21 
 
 		 749 aa  205  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  36.09 
 
 		 315 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  26.52 
 
 		 706 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  30.39 
 
 		 884 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  22.38 
 
 		 735 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  26.41 
 
 		 862 aa  145  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  26.61 
 
 		 736 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  27.46 
 
 		 715 aa  144  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  31.07 
 
 		 419 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  30.88 
 
 		 577 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  26.12 
 
 		 784 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2072  KAP P-loop  24.23 
 
 		 997 aa  89  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.285295 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  24.76 
 
 		 672 aa  88.2  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  25.99 
 
 		 945 aa  85.5  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1936  hypothetical protein  22.32 
 
 		 978 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000106944 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  26.95 
 
 		 564 aa  76.6  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  23.33 
 
 		 976 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  23.47 
 
 		 591 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  23.17 
 
 		 594 aa  57.8  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  22.38 
 
 		 628 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  22.38 
 
 		 628 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  22.38 
 
 		 628 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  22.02 
 
 		 623 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  21.77 
 
 		 671 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  20.89 
 
 		 463 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  24.71 
 
 		 1093 aa  52  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  20.89 
 
 		 463 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  22.14 
 
 		 467 aa  51.6  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  21.76 
 
 		 461 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  22.92 
 
 		 622 aa  48.5  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  21.71 
 
 		 513 aa  48.5  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1968  KAP P-loop domain protein  26.32 
 
 		 1137 aa  47.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.82 
 
 		 830 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  20.34 
 
 		 601 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  22.31 
 
 		 647 aa  46.6  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1065 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  22.75 
 
 		 443 aa  44.3  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  21.46 
 
 		 644 aa  43.9  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>