50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1063 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 		 467 aa  954    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  35.76 
 
 		 463 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  35.76 
 
 		 463 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  33.16 
 
 		 471 aa  220  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  31.33 
 
 		 509 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  29.09 
 
 		 506 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  30.56 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  32.09 
 
 		 565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  31.87 
 
 		 579 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  28.57 
 
 		 580 aa  136  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  28.01 
 
 		 464 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  32.28 
 
 		 542 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  31.72 
 
 		 489 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  30.56 
 
 		 571 aa  130  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  30.79 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  26.79 
 
 		 510 aa  123  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  28.1 
 
 		 488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  27.06 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1179  hypothetical protein  26.63 
 
 		 406 aa  113  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  27.41 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  27.41 
 
 		 443 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  23.9 
 
 		 564 aa  86.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  26.55 
 
 		 650 aa  76.6  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  26.21 
 
 		 647 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  24.74 
 
 		 644 aa  71.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  22.14 
 
 		 461 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  27.38 
 
 		 591 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  25.08 
 
 		 615 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  23.94 
 
 		 594 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  24.46 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  23.87 
 
 		 622 aa  63.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  23.24 
 
 		 736 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  22.88 
 
 		 628 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  22.88 
 
 		 628 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  22.88 
 
 		 628 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  24.01 
 
 		 623 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  23.74 
 
 		 749 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  22.58 
 
 		 976 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  23.78 
 
 		 601 aa  53.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  21.1 
 
 		 706 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  21.96 
 
 		 1093 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  22.14 
 
 		 706 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  21.18 
 
 		 715 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  24.01 
 
 		 728 aa  47  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  18.59 
 
 		 945 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  19.32 
 
 		 671 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  22.32 
 
 		 770 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0709  hypothetical protein  40.38 
 
 		 1064 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  25.31 
 
 		 758 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.33 
 
 		 830 aa  43.1  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>