41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2638 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 		 459 aa  951    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  60.78 
 
 		 488 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  58.52 
 
 		 489 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  40.63 
 
 		 510 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  47.04 
 
 		 394 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  33.87 
 
 		 565 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  31.76 
 
 		 509 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  31.37 
 
 		 506 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  33.03 
 
 		 579 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  30.91 
 
 		 580 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  28.57 
 
 		 542 aa  146  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  31.34 
 
 		 571 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  30.79 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  31.15 
 
 		 471 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  31.37 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  31.37 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  30.64 
 
 		 444 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  25.2 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  30.36 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  30.54 
 
 		 464 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  25.48 
 
 		 564 aa  75.1  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_002978  WD1179  hypothetical protein  22.75 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  23.02 
 
 		 622 aa  60.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  36.36 
 
 		 1093 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  24.61 
 
 		 591 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  31.17 
 
 		 623 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  25.56 
 
 		 615 aa  56.6  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  32.53 
 
 		 594 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  31.25 
 
 		 671 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  23.73 
 
 		 628 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  23.73 
 
 		 628 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  23.73 
 
 		 628 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  31.58 
 
 		 601 aa  51.2  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1065 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  30.67 
 
 		 650 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  30.67 
 
 		 644 aa  50.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  24.44 
 
 		 735 aa  50.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  29.33 
 
 		 647 aa  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  33.73 
 
 		 787 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  29.41 
 
 		 513 aa  47  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  22.69 
 
 		 461 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>