49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1445 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  100 
 
 		 461 aa  932    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  26.79 
 
 		 671 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  25.25 
 
 		 513 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  26.57 
 
 		 564 aa  88.6  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  26.49 
 
 		 650 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  24.46 
 
 		 623 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  28.57 
 
 		 622 aa  80.5  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  25.93 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  25.93 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  26.74 
 
 		 647 aa  79.7  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  25.2 
 
 		 591 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  24.05 
 
 		 594 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  26.54 
 
 		 644 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  25.95 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  22.22 
 
 		 628 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  22.22 
 
 		 628 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  22.22 
 
 		 628 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  25.73 
 
 		 749 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  26.34 
 
 		 728 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  27.23 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  24.42 
 
 		 758 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  22.14 
 
 		 467 aa  66.6  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1065 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  24.09 
 
 		 787 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  22.99 
 
 		 615 aa  61.6  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.35 
 
 		 830 aa  60.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  21.4 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  23.75 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  22.76 
 
 		 736 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  24.52 
 
 		 884 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  22.38 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  22.07 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  27.72 
 
 		 601 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  25.21 
 
 		 315 aa  54.3  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  23.08 
 
 		 735 aa  51.6  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  20.16 
 
 		 945 aa  50.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  21.76 
 
 		 706 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  25.83 
 
 		 611 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  22.01 
 
 		 489 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  23.27 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2201  KAP P-loop  27.42 
 
 		 1128 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  22.69 
 
 		 459 aa  46.6  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  23.1 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0709  hypothetical protein  36.07 
 
 		 1064 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  20.18 
 
 		 715 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  24.56 
 
 		 770 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  21.56 
 
 		 565 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  22.14 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1968  KAP P-loop domain protein  22.34 
 
 		 1137 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>