50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0128 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  100 
 
 		 471 aa  964    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  33.16 
 
 		 467 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  33.63 
 
 		 463 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  33.63 
 
 		 463 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  37.04 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  34.64 
 
 		 542 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  33.56 
 
 		 580 aa  157  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  31.44 
 
 		 506 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  34.96 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  30.1 
 
 		 571 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  30.8 
 
 		 565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  28.61 
 
 		 394 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  31.52 
 
 		 509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  34.22 
 
 		 510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  31.15 
 
 		 459 aa  126  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  31.67 
 
 		 489 aa  123  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  30.43 
 
 		 444 aa  120  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  29.56 
 
 		 488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  25.22 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  27.82 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_002978  WD1179  hypothetical protein  24.78 
 
 		 406 aa  89.7  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  25.44 
 
 		 564 aa  80.5  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  20.96 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  27.23 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  23.79 
 
 		 623 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  24.26 
 
 		 594 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  32.48 
 
 		 601 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  24.03 
 
 		 735 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  24.28 
 
 		 628 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  24.28 
 
 		 628 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  24.28 
 
 		 628 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  25.96 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  25.25 
 
 		 622 aa  60.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  26.15 
 
 		 644 aa  60.1  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  20.14 
 
 		 671 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  25.4 
 
 		 650 aa  57.4  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  22.92 
 
 		 736 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  22.03 
 
 		 706 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  24.71 
 
 		 647 aa  53.5  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  23.73 
 
 		 945 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  23.78 
 
 		 715 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1065 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  22.57 
 
 		 1093 aa  50.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  22.81 
 
 		 615 aa  50.1  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  25 
 
 		 784 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  29.29 
 
 		 787 aa  47  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.81 
 
 		 830 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  23.97 
 
 		 770 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  24.58 
 
 		 976 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  23.58 
 
 		 611 aa  43.9  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>