44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3681 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  65.85 
 
 		 489 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 		 488 aa  1011    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  60.78 
 
 		 459 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  39.6 
 
 		 510 aa  359  8e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  45.09 
 
 		 394 aa  341  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  30.87 
 
 		 509 aa  163  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  34.71 
 
 		 542 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  31.18 
 
 		 506 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  31.28 
 
 		 565 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  30.82 
 
 		 571 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  28.69 
 
 		 579 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  29.38 
 
 		 580 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  28.1 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  29.56 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  32.28 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  32.28 
 
 		 463 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  29.01 
 
 		 444 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  29.67 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  26.02 
 
 		 464 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  30.22 
 
 		 443 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  26.37 
 
 		 1093 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1179  hypothetical protein  22.61 
 
 		 406 aa  67  0.0000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  25.27 
 
 		 564 aa  66.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  22.03 
 
 		 591 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  23.59 
 
 		 594 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  25.1 
 
 		 622 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  27.84 
 
 		 601 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  20.74 
 
 		 623 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  31.71 
 
 		 647 aa  51.2  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  24.39 
 
 		 671 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  30.49 
 
 		 644 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  30.49 
 
 		 650 aa  50.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  23.04 
 
 		 513 aa  50.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1065 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  22.99 
 
 		 615 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  19.35 
 
 		 628 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  19.35 
 
 		 628 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  19.35 
 
 		 628 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  23.85 
 
 		 735 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  22.66 
 
 		 715 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  22.14 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  21.21 
 
 		 758 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  28.74 
 
 		 787 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  25.6 
 
 		 770 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>