35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2476 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 		 443 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  38.76 
 
 		 445 aa  306  6e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  25.74 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  32.96 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  27.38 
 
 		 506 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  29.71 
 
 		 542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  28.33 
 
 		 571 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  30.22 
 
 		 488 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  29.61 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  29.61 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  28.94 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  29.76 
 
 		 580 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  30.35 
 
 		 579 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  27.82 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  25.53 
 
 		 565 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  30.36 
 
 		 459 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  30.42 
 
 		 489 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  31.09 
 
 		 394 aa  97.8  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  27.41 
 
 		 467 aa  97.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  27.55 
 
 		 510 aa  96.3  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  25.94 
 
 		 564 aa  54.7  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  22.47 
 
 		 628 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  22.47 
 
 		 628 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  22.47 
 
 		 628 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  35.53 
 
 		 594 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  22.18 
 
 		 615 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  29.47 
 
 		 623 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  22.61 
 
 		 706 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_002978  WD1179  hypothetical protein  25.66 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  25 
 
 		 601 aa  47.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  23.35 
 
 		 715 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.94 
 
 		 830 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  22.11 
 
 		 671 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  24.29 
 
 		 622 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  22.75 
 
 		 706 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>