38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3806 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  100 
 
 
579 aa  1201    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  72.95 
 
 
580 aa  852    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  49.49 
 
 
571 aa  531  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  47.15 
 
 
542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  44.11 
 
 
565 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  41.96 
 
 
506 aa  298  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  37.04 
 
 
471 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  29.17 
 
 
394 aa  163  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  33.03 
 
 
459 aa  160  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  33.78 
 
 
509 aa  153  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  32.17 
 
 
463 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  32.17 
 
 
463 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  30.16 
 
 
489 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  29.83 
 
 
510 aa  140  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  31.87 
 
 
467 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  28.69 
 
 
488 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  31.89 
 
 
445 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  28.62 
 
 
464 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  30.35 
 
 
443 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  28.79 
 
 
444 aa  95.9  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  24.46 
 
 
564 aa  78.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_002978  WD1179  hypothetical protein  24.08 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  23.59 
 
 
622 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  25.85 
 
 
601 aa  55.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  22.01 
 
 
628 aa  53.9  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  22.01 
 
 
628 aa  53.9  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  22.01 
 
 
628 aa  53.9  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  21.88 
 
 
513 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  25.32 
 
 
594 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  25.96 
 
 
650 aa  50.8  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  25 
 
 
591 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  26.58 
 
 
644 aa  50.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  38.46 
 
 
615 aa  48.9  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  26.1 
 
 
647 aa  47.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  24.51 
 
 
623 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  19.39 
 
 
671 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  26.88 
 
 
1093 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  22.64 
 
 
784 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>