49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3357 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  99.57 
 
 		 463 aa  944    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 		 463 aa  947    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  35.76 
 
 		 467 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  32.96 
 
 		 471 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  29.15 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  31.59 
 
 		 542 aa  156  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  28.03 
 
 		 579 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  37.45 
 
 		 509 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  30.4 
 
 		 565 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  28.33 
 
 		 580 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  29.37 
 
 		 506 aa  142  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  27.72 
 
 		 571 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  25.72 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  32.51 
 
 		 394 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  31.37 
 
 		 459 aa  120  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  29.73 
 
 		 510 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  28.61 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  32.28 
 
 		 488 aa  113  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  27.32 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  29.61 
 
 		 443 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_002978  WD1179  hypothetical protein  23.84 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  26.57 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  24.66 
 
 		 564 aa  80.1  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  25.2 
 
 		 591 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  23.24 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  25.21 
 
 		 622 aa  63.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  24.1 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  22.44 
 
 		 650 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  23.91 
 
 		 647 aa  61.6  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  22.59 
 
 		 644 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  22.65 
 
 		 615 aa  61.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  23.43 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  23.21 
 
 		 628 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  23.21 
 
 		 628 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  23.21 
 
 		 628 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  32.29 
 
 		 601 aa  56.6  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  21.2 
 
 		 671 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  21.82 
 
 		 976 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2072  KAP P-loop  25.45 
 
 		 997 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.285295 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  20.89 
 
 		 706 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  18.86 
 
 		 706 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  22.78 
 
 		 1093 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  21.29 
 
 		 736 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  23.28 
 
 		 749 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  21.26 
 
 		 735 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  22.22 
 
 		 945 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1936  hypothetical protein  26.36 
 
 		 978 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000106944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  21.27 
 
 		 715 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  23.26 
 
 		 672 aa  43.1  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>