39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0414 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 		 565 aa  1176    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  47.84 
 
 		 571 aa  514  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  44.11 
 
 		 579 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  43.68 
 
 		 580 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  51.82 
 
 		 542 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  37.69 
 
 		 506 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  33.87 
 
 		 459 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  34.07 
 
 		 510 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  33.11 
 
 		 394 aa  159  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  32.28 
 
 		 509 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  32.56 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  31.28 
 
 		 488 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  32.09 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  32.44 
 
 		 463 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  32.44 
 
 		 463 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  30.8 
 
 		 471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  31.35 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  26.67 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  25.53 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  24.75 
 
 		 444 aa  93.2  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  22.79 
 
 		 564 aa  65.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_002978  WD1179  hypothetical protein  22.92 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  25.08 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  23.37 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  23.37 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  23.37 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  21.18 
 
 		 650 aa  54.7  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  23.97 
 
 		 622 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  21.98 
 
 		 647 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  24.82 
 
 		 644 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  34.62 
 
 		 513 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  39.22 
 
 		 615 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  23.63 
 
 		 594 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  23.05 
 
 		 735 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  23.57 
 
 		 770 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 		 830 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  21.56 
 
 		 461 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  38 
 
 		 601 aa  44.3  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  36.96 
 
 		 623 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>