31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0158 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 		 445 aa  915    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  38.76 
 
 		 443 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  27.73 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  32.23 
 
 		 506 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  31.82 
 
 		 542 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  31.89 
 
 		 579 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  26.8 
 
 		 489 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  32.11 
 
 		 580 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  30.77 
 
 		 571 aa  116  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  28.28 
 
 		 444 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  31.35 
 
 		 565 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  32.56 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  27.06 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  27.76 
 
 		 509 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  29.67 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  29.23 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  25.2 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  29.23 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  25.22 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  26.02 
 
 		 510 aa  103  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  24.19 
 
 		 594 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_002978  WD1179  hypothetical protein  22.81 
 
 		 406 aa  53.1  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  25.51 
 
 		 564 aa  50.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  21.9 
 
 		 628 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  21.9 
 
 		 628 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  21.9 
 
 		 628 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  23.27 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  31.03 
 
 		 671 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  32.1 
 
 		 601 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  23.11 
 
 		 715 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  23.18 
 
 		 623 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>