36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5045 on replicon NC_013748
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  100 
 
 
1093 aa  2227    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1968  KAP P-loop domain protein  27.64 
 
 
1137 aa  158  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  23.51 
 
 
564 aa  90.5  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  23.4 
 
 
513 aa  78.2  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2201  KAP P-loop  22.32 
 
 
1128 aa  77.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  22.39 
 
 
650 aa  72.4  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  26.37 
 
 
488 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  22.51 
 
 
671 aa  66.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  24.03 
 
 
615 aa  64.3  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  37.97 
 
 
394 aa  59.3  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  21.73 
 
 
749 aa  58.2  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  36.36 
 
 
459 aa  58.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  21.96 
 
 
467 aa  52.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  23.49 
 
 
715 aa  52.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  24.71 
 
 
706 aa  52  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  42 
 
 
1065 aa  52  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  31.18 
 
 
489 aa  51.6  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  19.58 
 
 
758 aa  51.6  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  20.78 
 
 
736 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  20.7 
 
 
315 aa  51.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  22.57 
 
 
471 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  35.9 
 
 
623 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  19.34 
 
 
644 aa  50.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  25.68 
 
 
735 aa  50.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1090  KAP P-loop domain-containing protein  25.56 
 
 
1234 aa  50.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.537564  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  47.73 
 
 
591 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  25 
 
 
594 aa  48.9  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  29.91 
 
 
884 aa  48.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  27.68 
 
 
787 aa  48.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  28.26 
 
 
510 aa  47.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  19.43 
 
 
647 aa  47.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.05 
 
 
830 aa  48.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  22.37 
 
 
463 aa  45.8  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  22.37 
 
 
463 aa  45.8  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  26.88 
 
 
579 aa  45.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0709  hypothetical protein  31.34 
 
 
1064 aa  45.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>