40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001492 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  100 
 
 		 758 aa  1546    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  26.29 
 
 		 706 aa  251  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  27.91 
 
 		 884 aa  165  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  26 
 
 		 749 aa  157  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  29.07 
 
 		 577 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  29.02 
 
 		 315 aa  151  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  24.29 
 
 		 706 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  26.52 
 
 		 728 aa  141  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  23.53 
 
 		 736 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  24.5 
 
 		 862 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  23.48 
 
 		 715 aa  122  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  21.3 
 
 		 735 aa  94.4  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  23.19 
 
 		 784 aa  94  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  25.64 
 
 		 419 aa  88.2  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  25.07 
 
 		 671 aa  80.9  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  24.42 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  25.09 
 
 		 594 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  24.68 
 
 		 591 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  23.35 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  25.23 
 
 		 644 aa  61.6  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  25.68 
 
 		 622 aa  61.6  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  26.35 
 
 		 647 aa  60.8  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  24.42 
 
 		 650 aa  54.7  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  22.62 
 
 		 623 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  25.18 
 
 		 394 aa  53.9  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1065 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  21.97 
 
 		 615 aa  52.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  19.58 
 
 		 1093 aa  51.6  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  22.18 
 
 		 976 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  29 
 
 		 601 aa  49.3  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1936  hypothetical protein  29.59 
 
 		 978 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000106944 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  22.74 
 
 		 628 aa  48.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  22.74 
 
 		 628 aa  48.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  22.74 
 
 		 628 aa  48.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2072  KAP P-loop  29.59 
 
 		 997 aa  46.6  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.285295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2201  KAP P-loop  28.23 
 
 		 1128 aa  45.8  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  23.04 
 
 		 672 aa  45.4  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  21.21 
 
 		 488 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25 
 
 		 830 aa  45.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  25.31 
 
 		 467 aa  44.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>