22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3848 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3848  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 		 925 aa  1903    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000964208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.11 
 
 		 830 aa  204  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  21.19 
 
 		 1065 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  23.14 
 
 		 671 aa  67.8  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  31.4 
 
 		 736 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  23.62 
 
 		 787 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  34.02 
 
 		 594 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  25.85 
 
 		 611 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  22.67 
 
 		 623 aa  52  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  24.53 
 
 		 628 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  24.53 
 
 		 628 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  24.53 
 
 		 628 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  30.77 
 
 		 644 aa  50.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  29.41 
 
 		 564 aa  49.7  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2201  KAP P-loop  22.25 
 
 		 1128 aa  49.7  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  32.67 
 
 		 615 aa  49.7  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  32.63 
 
 		 601 aa  49.3  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  29.84 
 
 		 591 aa  48.1  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  31.76 
 
 		 862 aa  47.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  28.85 
 
 		 647 aa  46.6  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  29 
 
 		 650 aa  46.2  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0709  hypothetical protein  40 
 
 		 1064 aa  45.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>