53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0552 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  100 
 
 		 295 aa  590  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  40.22 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  36.63 
 
 		 385 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  33.83 
 
 		 381 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  36.21 
 
 		 385 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  36.21 
 
 		 385 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0078  hypothetical protein  34.48 
 
 		 386 aa  96.3  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  34.52 
 
 		 385 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  34.52 
 
 		 385 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0037  lipoprotein  33.52 
 
 		 405 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173874  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5690  putative lipoprotein  32.56 
 
 		 397 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1814  putative lipoprotein  34.1 
 
 		 388 aa  89.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0659201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1914  putative lipoprotein  34.1 
 
 		 388 aa  89.7  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4582  putative lipoprotein  34.52 
 
 		 391 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0056  putative lipoprotein  34.92 
 
 		 401 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6452  hypothetical protein  33.92 
 
 		 385 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5587  hypothetical protein  33.92 
 
 		 385 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5951  hypothetical protein  33.92 
 
 		 385 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195751  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0400  putative lipoprotein  25.91 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0707087  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2263  lipoprotein  33.52 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3517  putative lipoprotein  33.15 
 
 		 392 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00869798  normal  0.0619249 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2141  hypothetical protein  31.28 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.19798  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001627  putative lipoprotein  26.11 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000609  putative lipoprotein  24.76 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000703703  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1816  hypothetical protein  30.73 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.202268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  29.55 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3610  hypothetical protein  24.64 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0231104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1740  hypothetical protein  30.17 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.049047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2772  hypothetical protein  27.87 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0449  putative lipoprotein  25.81 
 
 		 338 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234501  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0938  putative lipoprotein  26.35 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2599  hypothetical protein  23.25 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00476965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2018  hypothetical protein  28.7 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2028  hypothetical protein  25.17 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal  0.315277 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1468  hypothetical protein  28.09 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.314468 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03570  probable lipoprotein  30.85 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.758771  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1948  hypothetical protein  24.73 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0345461  normal  0.211381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1754  hypothetical protein  31.67 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.477178  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2963  putative lipoprotein  26.35 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.881094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2311  hypothetical protein  28.92 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.466127  normal  0.419829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0873  putative lipoprotein  23.21 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.558011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1556  hypothetical protein  28.17 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0978629  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3409  putative lipoprotein  21.75 
 
 		 343 aa  52.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0908  putative lipoprotein  23.47 
 
 		 335 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.208396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  23.05 
 
 		 326 aa  52.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3064  putative lipoprotein  21.84 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0230336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3095  hypothetical protein  31.4 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2615  hypothetical protein  27.59 
 
 		 554 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1451  hypothetical protein  31.43 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0531522  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1546  hypothetical protein  31.43 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0432923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2412  hypothetical protein  31.43 
 
 		 344 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0571766  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1659  hypothetical protein  25.79 
 
 		 250 aa  43.5  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.377784  normal  0.672635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>