36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5690 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5690  putative lipoprotein  100 
 
 		 397 aa  778    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2263  lipoprotein  74.51 
 
 		 391 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4582  putative lipoprotein  72.83 
 
 		 391 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370961 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  65.3 
 
 		 385 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  63.48 
 
 		 385 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  63.48 
 
 		 385 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0078  hypothetical protein  65.74 
 
 		 386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  66.3 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  66.3 
 
 		 385 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6452  hypothetical protein  66.67 
 
 		 385 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5951  hypothetical protein  66.67 
 
 		 385 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195751  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5587  hypothetical protein  66.67 
 
 		 385 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0037  lipoprotein  60.56 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1914  putative lipoprotein  41.55 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1814  putative lipoprotein  41 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0659201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3517  putative lipoprotein  41.16 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00869798  normal  0.0619249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0056  putative lipoprotein  38.58 
 
 		 401 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2141  hypothetical protein  35.17 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.19798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2311  hypothetical protein  36.94 
 
 		 476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.466127  normal  0.419829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1816  hypothetical protein  34.39 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.202268  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1740  hypothetical protein  33.53 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.049047  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  32.02 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1468  hypothetical protein  36.21 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.314468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1754  hypothetical protein  41.67 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.477178  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2772  hypothetical protein  34.8 
 
 		 310 aa  106  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1556  hypothetical protein  39.44 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0978629  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  29.52 
 
 		 381 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03570  probable lipoprotein  39.06 
 
 		 250 aa  96.7  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.758771  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  32.14 
 
 		 295 aa  87  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0241  hypothetical protein  33.18 
 
 		 316 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000967263  hitchhiker  0.000000000125048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2018  hypothetical protein  32.82 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2615  hypothetical protein  30.42 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3095  hypothetical protein  27.13 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0914  hypothetical protein  29.31 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>