35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1814 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1914  putative lipoprotein  98.45 
 
 
388 aa  748    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1814  putative lipoprotein  100 
 
 
388 aa  764    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0659201  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3517  putative lipoprotein  59.67 
 
 
392 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00869798  normal  0.0619249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0056  putative lipoprotein  58.7 
 
 
401 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  45.88 
 
 
385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  44.99 
 
 
385 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  44.99 
 
 
385 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0037  lipoprotein  47.15 
 
 
405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173874  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0078  hypothetical protein  45.96 
 
 
386 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  45.28 
 
 
385 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  45 
 
 
385 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2263  lipoprotein  44.6 
 
 
391 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5587  hypothetical protein  45.38 
 
 
385 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5951  hypothetical protein  45.38 
 
 
385 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195751  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6452  hypothetical protein  44.82 
 
 
385 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4582  putative lipoprotein  42.94 
 
 
391 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370961 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5690  putative lipoprotein  40.44 
 
 
397 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2018  hypothetical protein  33.2 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  32.4 
 
 
381 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1816  hypothetical protein  33.33 
 
 
375 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.202268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2311  hypothetical protein  31.58 
 
 
476 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.466127  normal  0.419829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1740  hypothetical protein  37.44 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.049047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2141  hypothetical protein  37 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.19798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  29.88 
 
 
274 aa  96.7  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2772  hypothetical protein  34.72 
 
 
310 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  34.5 
 
 
295 aa  87.8  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1556  hypothetical protein  38.99 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0978629  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03570  probable lipoprotein  35.98 
 
 
250 aa  82.8  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.758771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  34.1 
 
 
312 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1468  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.314468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1754  hypothetical protein  38.12 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.477178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0241  hypothetical protein  30.63 
 
 
316 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000967263  hitchhiker  0.000000000125048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  31.77 
 
 
337 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3095  hypothetical protein  25 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2747  hypothetical protein  27.25 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>