36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4582 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4582  putative lipoprotein  100 
 
 
391 aa  770    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370961 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  70.05 
 
 
385 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2263  lipoprotein  74.23 
 
 
391 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5690  putative lipoprotein  72.83 
 
 
397 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  70.6 
 
 
385 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  70.6 
 
 
385 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0078  hypothetical protein  70.25 
 
 
386 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  68.23 
 
 
385 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  68.23 
 
 
385 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5587  hypothetical protein  69.19 
 
 
385 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5951  hypothetical protein  69.19 
 
 
385 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195751  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6452  hypothetical protein  69.19 
 
 
385 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0037  lipoprotein  53.8 
 
 
405 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1914  putative lipoprotein  43.77 
 
 
388 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1814  putative lipoprotein  42.94 
 
 
388 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0659201  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3517  putative lipoprotein  41.35 
 
 
392 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00869798  normal  0.0619249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0056  putative lipoprotein  37.99 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2311  hypothetical protein  36.3 
 
 
476 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.466127  normal  0.419829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2141  hypothetical protein  39.45 
 
 
376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.19798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1816  hypothetical protein  38.71 
 
 
375 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.202268  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1740  hypothetical protein  37.79 
 
 
375 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.049047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1754  hypothetical protein  41.11 
 
 
304 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.477178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  31.76 
 
 
274 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1556  hypothetical protein  37.91 
 
 
309 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0978629  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03570  probable lipoprotein  44.67 
 
 
250 aa  98.6  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.758771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1468  hypothetical protein  35.53 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.314468 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2772  hypothetical protein  34.45 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130623  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  32.42 
 
 
381 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2018  hypothetical protein  32.99 
 
 
265 aa  86.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  34.57 
 
 
295 aa  86.3  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  35.5 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  30 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0241  hypothetical protein  35.62 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000967263  hitchhiker  0.000000000125048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2615  hypothetical protein  28.83 
 
 
554 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3095  hypothetical protein  26.92 
 
 
298 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0914  hypothetical protein  30.51 
 
 
343 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>