35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1914 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1914  putative lipoprotein  100 
 
 		 388 aa  763    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1814  putative lipoprotein  98.45 
 
 		 388 aa  748    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0659201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3517  putative lipoprotein  59.67 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00869798  normal  0.0619249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0056  putative lipoprotein  58.42 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  46.43 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  45.5 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  45.5 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0078  hypothetical protein  46.52 
 
 		 386 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0037  lipoprotein  47.15 
 
 		 405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173874  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  45.83 
 
 		 385 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  45.56 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2263  lipoprotein  45.15 
 
 		 391 aa  235  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5587  hypothetical protein  45.94 
 
 		 385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5951  hypothetical protein  45.94 
 
 		 385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195751  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6452  hypothetical protein  45.38 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4582  putative lipoprotein  43.77 
 
 		 391 aa  225  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370961 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5690  putative lipoprotein  41.55 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2018  hypothetical protein  33.2 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1816  hypothetical protein  33.64 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.202268  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2141  hypothetical protein  34.65 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.19798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  32.68 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1740  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.049047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2311  hypothetical protein  32.21 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.466127  normal  0.419829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  30.28 
 
 		 274 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2772  hypothetical protein  32.26 
 
 		 310 aa  90.1  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  34.32 
 
 		 295 aa  87.8  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1556  hypothetical protein  36.18 
 
 		 309 aa  86.3  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0978629  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03570  probable lipoprotein  36.79 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.758771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  34.5 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1468  hypothetical protein  31.3 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.314468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1754  hypothetical protein  38.12 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.477178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0241  hypothetical protein  30.63 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000967263  hitchhiker  0.000000000125048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  31.77 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2747  hypothetical protein  28.57 
 
 		 373 aa  57  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3095  hypothetical protein  25 
 
 		 298 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.113059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>