39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0108 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  98.7 
 
 
385 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  98.7 
 
 
385 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0078  hypothetical protein  94.04 
 
 
386 aa  658    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  100 
 
 
385 aa  764    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  76.18 
 
 
385 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  75.65 
 
 
385 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5951  hypothetical protein  78.41 
 
 
385 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195751  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5587  hypothetical protein  78.41 
 
 
385 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6452  hypothetical protein  78.12 
 
 
385 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4582  putative lipoprotein  70.03 
 
 
391 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2263  lipoprotein  69.47 
 
 
391 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5690  putative lipoprotein  65.27 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0037  lipoprotein  55.46 
 
 
405 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1914  putative lipoprotein  45.79 
 
 
388 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1814  putative lipoprotein  45.22 
 
 
388 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0659201  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3517  putative lipoprotein  42.01 
 
 
392 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00869798  normal  0.0619249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0056  putative lipoprotein  40.79 
 
 
401 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2311  hypothetical protein  36.22 
 
 
476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.466127  normal  0.419829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  30.83 
 
 
274 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03570  probable lipoprotein  35.62 
 
 
250 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.758771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  35.71 
 
 
381 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1754  hypothetical protein  41.86 
 
 
304 aa  99.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.477178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1556  hypothetical protein  36.92 
 
 
309 aa  99.4  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0978629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2772  hypothetical protein  38.46 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130623  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2141  hypothetical protein  36.36 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.19798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1816  hypothetical protein  30.18 
 
 
375 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.202268  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1468  hypothetical protein  36.9 
 
 
311 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.314468 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1740  hypothetical protein  32.97 
 
 
375 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.049047  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  35.8 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2018  hypothetical protein  32.12 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  30.43 
 
 
337 aa  82.8  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0241  hypothetical protein  35.62 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000967263  hitchhiker  0.000000000125048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  33.19 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3095  hypothetical protein  26.07 
 
 
298 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2615  hypothetical protein  25.94 
 
 
554 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2747  hypothetical protein  31.71 
 
 
373 aa  47.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0914  hypothetical protein  26.5 
 
 
343 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0967  hypothetical protein  27.17 
 
 
308 aa  46.6  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  23.96 
 
 
326 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>