37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2263 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2263  lipoprotein  100 
 
 		 391 aa  765    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5690  putative lipoprotein  70.28 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4582  putative lipoprotein  71.76 
 
 		 391 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370961 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  68.77 
 
 		 385 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  69.32 
 
 		 385 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  69.32 
 
 		 385 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0078  hypothetical protein  69.7 
 
 		 386 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  65.31 
 
 		 385 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  65.05 
 
 		 385 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6452  hypothetical protein  66.24 
 
 		 385 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5951  hypothetical protein  66.24 
 
 		 385 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195751  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5587  hypothetical protein  66.24 
 
 		 385 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0037  lipoprotein  57.88 
 
 		 405 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1914  putative lipoprotein  45.15 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1814  putative lipoprotein  44.6 
 
 		 388 aa  253  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0659201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3517  putative lipoprotein  40.43 
 
 		 392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00869798  normal  0.0619249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0056  putative lipoprotein  40.79 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2311  hypothetical protein  35.52 
 
 		 476 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.466127  normal  0.419829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1816  hypothetical protein  34.89 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.202268  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2141  hypothetical protein  34.86 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.19798  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1740  hypothetical protein  39.13 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.049047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1754  hypothetical protein  42.68 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.477178  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  33.72 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1556  hypothetical protein  36.18 
 
 		 309 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0978629  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03570  probable lipoprotein  45.33 
 
 		 250 aa  100  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.758771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2772  hypothetical protein  35.32 
 
 		 310 aa  99.8  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  31.35 
 
 		 274 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1468  hypothetical protein  34.4 
 
 		 311 aa  96.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.314468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2018  hypothetical protein  32.99 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  33.14 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  31.44 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  32.49 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0241  hypothetical protein  33.17 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000967263  hitchhiker  0.000000000125048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3095  hypothetical protein  26.22 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2615  hypothetical protein  27.45 
 
 		 554 aa  56.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0914  hypothetical protein  29.17 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0967  hypothetical protein  27.15 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>