36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2018 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2018  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  531  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03570  probable lipoprotein  38.19 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.758771  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1816  hypothetical protein  41.86 
 
 		 375 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.202268  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1740  hypothetical protein  41.28 
 
 		 375 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.049047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2141  hypothetical protein  42.69 
 
 		 376 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.19798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  36.29 
 
 		 381 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3095  hypothetical protein  30.77 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1814  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 388 aa  108  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0659201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1914  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 388 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3517  putative lipoprotein  32.78 
 
 		 392 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00869798  normal  0.0619249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  33.8 
 
 		 385 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  33.8 
 
 		 385 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0056  putative lipoprotein  32.57 
 
 		 401 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  33.5 
 
 		 385 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  33.5 
 
 		 385 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4582  putative lipoprotein  35.29 
 
 		 391 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370961 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0078  hypothetical protein  33.73 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0037  lipoprotein  31.79 
 
 		 405 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173874  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5690  putative lipoprotein  35.09 
 
 		 397 aa  78.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2263  lipoprotein  35.12 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6452  hypothetical protein  29.46 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5587  hypothetical protein  29.46 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5951  hypothetical protein  29.46 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195751  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  33.94 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  27.17 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  28.86 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0241  hypothetical protein  29.79 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000967263  hitchhiker  0.000000000125048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1754  hypothetical protein  28.27 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.477178  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  28.26 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1556  hypothetical protein  29.06 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0978629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2311  hypothetical protein  26.18 
 
 		 476 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.466127  normal  0.419829 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2747  hypothetical protein  28.57 
 
 		 373 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2772  hypothetical protein  30.3 
 
 		 310 aa  48.9  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130623  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0445  hypothetical protein  26.27 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1468  hypothetical protein  29.26 
 
 		 311 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.314468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>