33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0241 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0241  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000967263  hitchhiker  0.000000000125048 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1556  hypothetical protein  58.78 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0978629  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1468  hypothetical protein  55.35 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.314468 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2772  hypothetical protein  52.37 
 
 		 310 aa  291  8e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1754  hypothetical protein  54.15 
 
 		 304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.477178  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  38.79 
 
 		 385 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  38.79 
 
 		 385 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3517  putative lipoprotein  35.43 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00869798  normal  0.0619249 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0078  hypothetical protein  37.35 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5690  putative lipoprotein  33.18 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  36.14 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  36.81 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  36.14 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0056  putative lipoprotein  37.87 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0037  lipoprotein  33.33 
 
 		 405 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173874  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4582  putative lipoprotein  35.62 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370961 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  31.41 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5951  hypothetical protein  33.17 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195751  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5587  hypothetical protein  33.17 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6452  hypothetical protein  33.17 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  32.26 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2263  lipoprotein  32.67 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03570  probable lipoprotein  34.32 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.758771  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1914  putative lipoprotein  29.7 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  28.73 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1814  putative lipoprotein  30.63 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0659201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2141  hypothetical protein  30.94 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.19798  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  24.31 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1816  hypothetical protein  36.22 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.202268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2018  hypothetical protein  28.77 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1740  hypothetical protein  35.96 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.049047  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0938  putative lipoprotein  28.28 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2311  hypothetical protein  26.36 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.466127  normal  0.419829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>