20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0938 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0938  putative lipoprotein  100 
 
 		 321 aa  644    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  25.55 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1948  hypothetical protein  25.16 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0345461  normal  0.211381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  27.3 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2028  hypothetical protein  25.16 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal  0.315277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0400  putative lipoprotein  26.86 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0707087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  29.08 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2599  hypothetical protein  22.75 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00476965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0873  putative lipoprotein  29.49 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.558011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  26.2 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3064  putative lipoprotein  28.75 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0230336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0908  putative lipoprotein  29.07 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.208396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0241  hypothetical protein  28.28 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000967263  hitchhiker  0.000000000125048 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001627  putative lipoprotein  28.36 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3610  hypothetical protein  23.65 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0231104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2168  hypothetical protein  21.81 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000609  putative lipoprotein  24.52 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000703703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3409  putative lipoprotein  26.25 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0449  putative lipoprotein  24.86 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2963  putative lipoprotein  26.04 
 
 		 358 aa  42.7  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.881094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>