18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2963 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2963  putative lipoprotein  100 
 
 		 358 aa  729    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.881094  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3409  putative lipoprotein  64.08 
 
 		 343 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0873  putative lipoprotein  61.32 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.558011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0400  putative lipoprotein  60.96 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0707087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3064  putative lipoprotein  60.34 
 
 		 335 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0230336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0908  putative lipoprotein  61.7 
 
 		 335 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.208396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0449  putative lipoprotein  59.32 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001627  putative lipoprotein  38.42 
 
 		 349 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000609  putative lipoprotein  33.6 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000703703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  26.17 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3610  hypothetical protein  25.38 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0231104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  27.93 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2168  hypothetical protein  25.23 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1948  hypothetical protein  25.31 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0345461  normal  0.211381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2028  hypothetical protein  25.15 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal  0.315277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  27.64 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2599  hypothetical protein  27.1 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00476965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  26.03 
 
 		 295 aa  46.6  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>