20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0908 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3064  putative lipoprotein  98.21 
 
 		 335 aa  675    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0230336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0908  putative lipoprotein  100 
 
 		 335 aa  685    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.208396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0873  putative lipoprotein  97.01 
 
 		 335 aa  668    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.558011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3409  putative lipoprotein  69.25 
 
 		 343 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0400  putative lipoprotein  62.99 
 
 		 340 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0707087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2963  putative lipoprotein  61.7 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.881094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0449  putative lipoprotein  59.24 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001627  putative lipoprotein  39.6 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000609  putative lipoprotein  35 
 
 		 345 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000703703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  28.95 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2599  hypothetical protein  27.38 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00476965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1948  hypothetical protein  26.84 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0345461  normal  0.211381 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  25.99 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2028  hypothetical protein  26.84 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal  0.315277 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3610  hypothetical protein  25 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0231104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2168  hypothetical protein  27.42 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  26.45 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0938  putative lipoprotein  29.13 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  32.71 
 
 		 381 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  22.45 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>