20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0400 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0400  putative lipoprotein  100 
 
 		 340 aa  697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0707087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3409  putative lipoprotein  66.96 
 
 		 343 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0873  putative lipoprotein  63.58 
 
 		 335 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.558011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3064  putative lipoprotein  63.28 
 
 		 335 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0230336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0908  putative lipoprotein  62.99 
 
 		 335 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.208396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2963  putative lipoprotein  60.96 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.881094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0449  putative lipoprotein  61.7 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001627  putative lipoprotein  39.43 
 
 		 349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000609  putative lipoprotein  32.86 
 
 		 345 aa  149  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000703703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3610  hypothetical protein  25.55 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0231104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 312 aa  96.7  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1948  hypothetical protein  26.01 
 
 		 333 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0345461  normal  0.211381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2028  hypothetical protein  26.3 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal  0.315277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2168  hypothetical protein  25.3 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  23.98 
 
 		 326 aa  92.4  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2599  hypothetical protein  26.63 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00476965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  28.43 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  24.16 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0938  putative lipoprotein  26.11 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  29.11 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>