19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2028 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1948  hypothetical protein  98.5 
 
 		 333 aa  678    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0345461  normal  0.211381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2028  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  686    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal  0.315277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2599  hypothetical protein  63.78 
 
 		 333 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00476965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2168  hypothetical protein  51.77 
 
 		 332 aa  315  5e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3610  hypothetical protein  47.56 
 
 		 328 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0231104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  45.73 
 
 		 326 aa  299  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0400  putative lipoprotein  26.59 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0707087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3409  putative lipoprotein  28.32 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0449  putative lipoprotein  26.77 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0873  putative lipoprotein  27.73 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.558011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3064  putative lipoprotein  26.84 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0230336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2963  putative lipoprotein  25.15 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.881094  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0908  putative lipoprotein  27.14 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.208396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001627  putative lipoprotein  26.1 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000609  putative lipoprotein  23.14 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000703703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0938  putative lipoprotein  24.82 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  24.83 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  23.85 
 
 		 337 aa  49.7  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2036  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  25.84 
 
 		 857 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.026609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>