19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3086 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  670    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2168  hypothetical protein  56.25 
 
 		 332 aa  352  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2599  hypothetical protein  48.48 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00476965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3610  hypothetical protein  46.49 
 
 		 328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0231104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1948  hypothetical protein  46.34 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0345461  normal  0.211381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2028  hypothetical protein  46.04 
 
 		 333 aa  292  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal  0.315277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0400  putative lipoprotein  23.98 
 
 		 340 aa  93.2  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0707087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2963  putative lipoprotein  26.17 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.881094  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3409  putative lipoprotein  26.94 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001627  putative lipoprotein  24.63 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0449  putative lipoprotein  26.11 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0873  putative lipoprotein  26.97 
 
 		 335 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.558011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000609  putative lipoprotein  24.55 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000703703  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0908  putative lipoprotein  25.99 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.208396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3064  putative lipoprotein  24.44 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0230336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0938  putative lipoprotein  24.67 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  25.25 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  21.07 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  22.4 
 
 		 295 aa  43.1  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>