19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3409 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3409  putative lipoprotein  100 
 
 		 343 aa  701    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3064  putative lipoprotein  70.15 
 
 		 335 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0230336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0873  putative lipoprotein  69.85 
 
 		 335 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.558011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0908  putative lipoprotein  69.25 
 
 		 335 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.208396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0400  putative lipoprotein  66.96 
 
 		 340 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0707087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2963  putative lipoprotein  64.08 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.881094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0449  putative lipoprotein  64.84 
 
 		 338 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001627  putative lipoprotein  38.14 
 
 		 349 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000609  putative lipoprotein  31.73 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000703703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  32.29 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1948  hypothetical protein  27.67 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0345461  normal  0.211381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2028  hypothetical protein  27.75 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal  0.315277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  26.94 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3610  hypothetical protein  26.97 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0231104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2168  hypothetical protein  25.07 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2599  hypothetical protein  27.59 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00476965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  25.48 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  31.3 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  21.12 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>