19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2599 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2599  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  689    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00476965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1948  hypothetical protein  64.09 
 
 		 333 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0345461  normal  0.211381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2028  hypothetical protein  63.78 
 
 		 333 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal  0.315277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2168  hypothetical protein  52.77 
 
 		 332 aa  323  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  48.61 
 
 		 326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3610  hypothetical protein  51.9 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0231104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0400  putative lipoprotein  26.63 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0707087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000609  putative lipoprotein  26.25 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000703703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3409  putative lipoprotein  27.3 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3064  putative lipoprotein  26.69 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0230336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0908  putative lipoprotein  27.38 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.208396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0449  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0873  putative lipoprotein  26.39 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.558011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001627  putative lipoprotein  25.96 
 
 		 349 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0938  putative lipoprotein  23.03 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  22.64 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2963  putative lipoprotein  27.1 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.881094  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  22.22 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  24.15 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>