19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3610 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3610  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  673    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0231104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2168  hypothetical protein  61.88 
 
 		 332 aa  411  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  46.86 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2599  hypothetical protein  48.15 
 
 		 333 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00476965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2028  hypothetical protein  46.6 
 
 		 333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal  0.315277 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1948  hypothetical protein  46.91 
 
 		 333 aa  305  6e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0345461  normal  0.211381 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0400  putative lipoprotein  25.45 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0707087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001627  putative lipoprotein  26.41 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3409  putative lipoprotein  27.09 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2963  putative lipoprotein  25.66 
 
 		 358 aa  89.4  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.881094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0449  putative lipoprotein  25.15 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0873  putative lipoprotein  25.73 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.558011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3064  putative lipoprotein  26.09 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0230336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0908  putative lipoprotein  25.29 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.208396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000609  putative lipoprotein  23.01 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000703703  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  22.78 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  25.61 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  25.09 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0938  putative lipoprotein  22.89 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>