20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0449 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0449  putative lipoprotein  100 
 
 		 338 aa  687    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3409  putative lipoprotein  64.84 
 
 		 343 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2963  putative lipoprotein  59.32 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.881094  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0400  putative lipoprotein  61.7 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0707087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3064  putative lipoprotein  59.24 
 
 		 335 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0230336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0908  putative lipoprotein  59.24 
 
 		 335 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.208396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0873  putative lipoprotein  58.94 
 
 		 335 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.558011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001627  putative lipoprotein  37.39 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000609  putative lipoprotein  36.6 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000703703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1948  hypothetical protein  26.02 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0345461  normal  0.211381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2028  hypothetical protein  26.46 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal  0.315277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  26.11 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3610  hypothetical protein  24.92 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0231104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2599  hypothetical protein  25.39 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00476965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2168  hypothetical protein  24.62 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  27.48 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  25.18 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  27.91 
 
 		 381 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  27.4 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>