19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3064 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3064  putative lipoprotein  100 
 
 		 335 aa  686    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0230336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0908  putative lipoprotein  98.21 
 
 		 335 aa  675    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.208396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0873  putative lipoprotein  97.01 
 
 		 335 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.558011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3409  putative lipoprotein  70.15 
 
 		 343 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0400  putative lipoprotein  63.28 
 
 		 340 aa  431  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0707087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2963  putative lipoprotein  60.34 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.881094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0449  putative lipoprotein  59.24 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001627  putative lipoprotein  39.02 
 
 		 349 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000609  putative lipoprotein  35 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000703703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1948  hypothetical protein  26.84 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0345461  normal  0.211381 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2599  hypothetical protein  26.69 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00476965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2028  hypothetical protein  26.84 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal  0.315277 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  28.62 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  24.44 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3610  hypothetical protein  25.85 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0231104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2168  hypothetical protein  27.1 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0938  putative lipoprotein  28.8 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  25.24 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  29.79 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>