18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1948 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1948  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  687    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0345461  normal  0.211381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2028  hypothetical protein  98.5 
 
 		 333 aa  678    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal  0.315277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2599  hypothetical protein  64.09 
 
 		 333 aa  450  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00476965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2168  hypothetical protein  52.09 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3610  hypothetical protein  47.88 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0231104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  46.04 
 
 		 326 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3409  putative lipoprotein  28.24 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0400  putative lipoprotein  26.3 
 
 		 340 aa  99.8  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0707087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0449  putative lipoprotein  26.33 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0873  putative lipoprotein  27.73 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.558011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3064  putative lipoprotein  26.84 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0230336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0908  putative lipoprotein  27.14 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.208396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2963  putative lipoprotein  25.31 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.881094  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001627  putative lipoprotein  26.39 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000609  putative lipoprotein  24 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000703703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0938  putative lipoprotein  24.82 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  24.37 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  23.72 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>