38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3404 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  99.48 
 
 		 385 aa  762    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  765    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6452  hypothetical protein  88.8 
 
 		 385 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5951  hypothetical protein  89.06 
 
 		 385 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195751  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5587  hypothetical protein  89.06 
 
 		 385 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  77.22 
 
 		 385 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  75.65 
 
 		 385 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  75.65 
 
 		 385 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0078  hypothetical protein  78.43 
 
 		 386 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4582  putative lipoprotein  67.97 
 
 		 391 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2263  lipoprotein  67.79 
 
 		 391 aa  448  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5690  putative lipoprotein  66.11 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0037  lipoprotein  55.07 
 
 		 405 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1914  putative lipoprotein  45.1 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1814  putative lipoprotein  44.54 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0659201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3517  putative lipoprotein  41.29 
 
 		 392 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00869798  normal  0.0619249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0056  putative lipoprotein  39.47 
 
 		 401 aa  196  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  30.5 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1556  hypothetical protein  41.34 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0978629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2772  hypothetical protein  39.46 
 
 		 310 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  33.6 
 
 		 274 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1468  hypothetical protein  39.68 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.314468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1754  hypothetical protein  43.31 
 
 		 304 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.477178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2311  hypothetical protein  33.59 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.466127  normal  0.419829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1816  hypothetical protein  38.68 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.202268  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2141  hypothetical protein  34.45 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.19798  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03570  probable lipoprotein  37.44 
 
 		 250 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.758771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1740  hypothetical protein  37.86 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.049047  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  33.95 
 
 		 295 aa  90.1  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2018  hypothetical protein  32.47 
 
 		 265 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0241  hypothetical protein  37.5 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000967263  hitchhiker  0.000000000125048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  32.81 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  27.65 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3095  hypothetical protein  25.85 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2615  hypothetical protein  26.23 
 
 		 554 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0967  hypothetical protein  29.38 
 
 		 308 aa  47.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  22.18 
 
 		 326 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0914  hypothetical protein  27.83 
 
 		 343 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>