27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3095 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3095  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2018  hypothetical protein  31.01 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03570  probable lipoprotein  31.71 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.758771  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1816  hypothetical protein  28.5 
 
 		 375 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.202268  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1740  hypothetical protein  27.98 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.049047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2141  hypothetical protein  27.6 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.19798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  25.78 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  26.23 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5690  putative lipoprotein  27.16 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  26.23 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  25.85 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4582  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  25.85 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  26.07 
 
 		 385 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0078  hypothetical protein  25.59 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1914  putative lipoprotein  24.81 
 
 		 388 aa  53.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1814  putative lipoprotein  24.81 
 
 		 388 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0659201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5483  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.549887  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6452  hypothetical protein  30.43 
 
 		 385 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5951  hypothetical protein  30.43 
 
 		 385 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195751  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  31.4 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5587  hypothetical protein  30.43 
 
 		 385 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0037  lipoprotein  23.88 
 
 		 405 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  33.88 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0123  hypothetical protein  36.05 
 
 		 103 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.646333  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2263  lipoprotein  25.75 
 
 		 391 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1152  hypothetical protein  32.93 
 
 		 105 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.450808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>