36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0056 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0056  putative lipoprotein  100 
 
 		 401 aa  786    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3517  putative lipoprotein  67.65 
 
 		 392 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00869798  normal  0.0619249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1914  putative lipoprotein  58.2 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1814  putative lipoprotein  58.74 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0659201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0037  lipoprotein  41.94 
 
 		 405 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173874  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  41.09 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2263  lipoprotein  40.74 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  41.19 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  41.19 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  40.74 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  40.74 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0078  hypothetical protein  41.08 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5690  putative lipoprotein  38.4 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5587  hypothetical protein  38.17 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5951  hypothetical protein  38.17 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195751  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6452  hypothetical protein  37.9 
 
 		 385 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4582  putative lipoprotein  37.93 
 
 		 391 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2311  hypothetical protein  35.93 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.466127  normal  0.419829 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1754  hypothetical protein  42.5 
 
 		 304 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.477178  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  37.06 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2018  hypothetical protein  31.58 
 
 		 265 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1556  hypothetical protein  38.69 
 
 		 309 aa  90.5  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0978629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2772  hypothetical protein  38.67 
 
 		 310 aa  87  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  28.68 
 
 		 274 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1468  hypothetical protein  37.78 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.314468 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  34.62 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  33.7 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1740  hypothetical protein  34.4 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.049047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1816  hypothetical protein  34 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.202268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0241  hypothetical protein  37.87 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000967263  hitchhiker  0.000000000125048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  35 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2141  hypothetical protein  33.86 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.19798  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03570  probable lipoprotein  33.07 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.758771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2615  hypothetical protein  27.33 
 
 		 554 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0449  putative lipoprotein  31.44 
 
 		 338 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0400  putative lipoprotein  31.71 
 
 		 340 aa  43.5  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0707087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>